Lokale Dateien durchsuchen
„Local Molecule Files“ ist der schnellste Weg, große lokale Chemiebibliotheken zu durchsuchen, ohne die Dateien einzeln im Finder öffnen zu müssen.
Der „Local Molecule Files“-Browser startet mit den Steuerelementen „Suchen“, „Nur Reaktionen“, „Finder-Bezeichnung“, „Sortieren“ und „Anordnen“. Die Ergebnisse werden als Karten im zentralen Raster angezeigt, und die Aktionsleiste unten enthält die Funktionen „Bezeichnung bearbeiten“, „Teilen“, „Quick Look“, „Finder anzeigen“, „In verwaltetes Repository übertragen“ und „Ausgewählte öffnen“. Wenn du mit gedrückter Ctrl-Taste auf eine Karte klickst, kannst du dieselben Aktionen über das Kontextmenü aufrufen.
Suchen und filtern
Gib Text in das Filterfeld ein und drücke Return oder klick Search um nach Dateinamen und indizierten chemischen Metadaten zu suchen. AtomLens nutzt Spotlight-Chemie-Schlüssel, sofern diese verfügbar sind, und greift auf unterstützte chemische Dateinamen zurück, wenn die ausführlicheren Metadaten fehlen oder noch nicht vollständig verfügbar sind.
- „Nur Reaktionen anzeigen“ beschränkt die Anzeige auf indizierte Reaktionsdateien.
- Die Schaltflächen mit den Finder-Bezeichnungen in der Filterleiste grenzen die Ergebnisliste auf passende Bezeichnungs-Kombinationen ein.
- Mit den Sortiersteuerelementen kannst du nach Änderungsdatum, Erstellungsdatum, Molekulargewicht oder LogP in aufsteigender oder absteigender Reihenfolge sortieren.
Statusmeldungen
Die Statusleiste unten zeigt den aktuellen Vorgang im Browser an. Ein Ladekreisel bedeutet, dass AtomLens noch beschäftigt ist; ein blauer Fortschrittsbalken erscheint, sobald der aktuelle Vorgang einen bestimmten Fortschritt erreicht hat, wie zum Beispiel beim Scannen des Managed Repositorys, beim Neuaufbau des Textindexes, bei der Validierung des Molekülindexes im Hintergrund oder beim Löschen eines Repositorys. In den folgenden Beispielen werden Beispielzahlen und Suchbegriffe verwendet; die Zahlen und Bezeichnungen in deinem Browser spiegeln die aktuelle Suche wider.
Suche in lokalen Dateien
| Beispielnachricht | Was das bedeutet |
|---|---|
Collecting molecule file references (1,240)...Collecting reaction file references for "Aspirin" (42)... | AtomLens sammelt Verweise auf lokale Dateien aus Spotlight. |
Indexed chemistry metadata looks incomplete (12). Falling back to supported filenames... | Spotlight hat zu wenige Treffer bei den Chemie-Metadaten geliefert, daher startet AtomLens eine auf Dateinamen basierende Ausweichsuche nach unterstützten Chemieformaten. |
Collecting supported chemistry file references (320)...Collecting supported reaction file references for "Aspirin" (18)... | AtomLens sammelt unterstützte Dateinamen, da die vollständigen Spotlight-Chemistry-Metadaten unvollständig sind. |
Found 1,240 molecule files. Loading metadata...Found 320 supported chemistry files. Loading metadata... | Die Referenzsammlung ist vollständig, und AtomLens ist dabei, die Metadaten der Karte zu laden. |
Loading molecule metadata (350/1,240)... | AtomLens reichert Ergebniskarten mit chemischen Metadaten, Datumsangaben, Bezeichnungen und für die Vorschau geeigneten Werten an. |
Showing cached results. Refreshing metadata (350/1,240)... | Ein Warm-Start-Cache ist sichtbar, während AtomLens im Hintergrund dieselbe Ergebnismenge für „Lokale Dateien“ aktualisiert. |
Loaded 1,240 molecule files.Loaded 42 reaction files. | Die Suche nach lokalen Dateien ist abgeschlossen. |
Local Files search could not start.Local Files search could not start filename fallback. | Die Spotlight-Abfrage oder die Fallback-Abfrage konnte nicht gestartet werden. |
Suche im verwalteten Repository
| Beispielnachricht | Was das bedeutet |
|---|---|
Scanning Managed Repository files...Scanning Managed Repository files (40,750/66,315, 61%)... | AtomLens liest Repository-Referenzen ein, wendet Repository-Filter an und bereitet die Ergebnismenge vor. Sobald Zahlen vorliegen, zeigt der Fortschrittsbalken denselben Prozentsatz an. |
Updating Managed Repository text index...Updating Managed Repository text index (40,750/66,315, 61%)... | AtomLens aktualisiert den lokalen Textindex im Hintergrund. Bei der Suche werden die bereits indizierten Datensätze verwendet, und die Ergebnisse werden aktualisiert, sobald weitere Datensätze verfügbar sind. Nur geänderte Datensätze müssen erneut indiziert werden. |
Search results may be incomplete while the text index updates.Text index update paused or incomplete. Search results may be incomplete. | Einige Datensätze sind noch nicht durchsuchbar. Nutze das Symbol „Pause“ oder „Fortsetzen“ neben dem Statustext, um die Indizierung zu steuern. Bereits gespeicherte Ergebnisse bleiben durchsuchbar, und beim Fortsetzen wird der gespeicherte Fortschritt fortgesetzt. Der Textindex wird lokal auf jedem Gerät gespeichert, nicht in iCloud. |
Loading repository metadata (350/1,240)... | Die entsprechenden Repository-Verweise werden in sichtbare Browser-Karten umgewandelt. |
Showing cached repository results. Refreshing metadata (350/1,240)... | Eine zwischengespeicherte Standardansicht des Managed Repositorys ist sichtbar, während AtomLens die Metadaten für den aktuellen Repository-Status aktualisiert. |
Loaded 1,240 Managed Repository files.Loaded 42 Managed Repository reaction files.Loaded 12 Managed Repository Markush structures. | Die aktive Suche im Managed Repository ist abgeschlossen. |
Hintergrundaktivitäten im Repository
| Beispielnachricht | Was das bedeutet |
|---|---|
Checking Managed Repository changes... | Der Repository-Beobachter überprüft Inhalts- und Metadaten-Stammverzeichnisse auf Änderungen, einschließlich der von iCloud unterstützten Stammverzeichnisse, wenn die Synchronisierung aktiviert ist. |
Validating molecule search index... | AtomLens überprüft oder erstellt den Molekülsuchindex neu, der für die Suche nach chemischen Verbindungen im Repository verwendet wird. |
Validating molecule search index (35%, scanning 23,000/66,315)...Validating molecule search index (72%, indexing 8,000/12,000)... | In der Validierungsphase gibt es eine bestimmte Anzahl von Items. |
Validating molecule search index (92%, writing cache)...Validating molecule search index (96%, updating cache)... | Die Validierungsphase hat einen Prozentsatz, aber keine Stückzahl. |
Uploading Managed Repository changes to iCloud...Downloading Managed Repository changes from iCloud... | Der Synchronisierungsaktivitätsmonitor „macOS iCloud“ meldet Upload- oder Download-Aktivitäten im Repository. |
Andere Ergebnisse der Statusleiste
Preparing to delete 12 Managed Repository entries...,Deleting Managed Repository entries..., undDeleting Managed Repository entries (8/12)...treten beim Löschen nur im Repository auf.Showing 500 of 1,240 files (700 loaded).wird angezeigt, wenn die Tabelle einen Teil der Treffer anzeigt, während geladene Einträge noch nachverfolgt werden.- Meldungen mit leerem Ergebnis können etwa so aussehen:
No indexed molecule or reaction files found.,No molecule files found.,No reaction files found.,No Markush structures found.,No Managed Repository files found., oderNo matching molecule files found.. - Zusammenfassungen zu Aktivfiltern können etwa so aussehen:
Active filters: Reactions only | Text: "Aspirin" | Labels: RedoderActive filters: Markush structures only. Idlekann auftreten, wenn das zugrunde liegende Suchmodell beendet wurde und kein Suchergebnisstatus aktiv ist.
Ergebniskarten
Browser-Karten zeigen mehr als nur Miniaturansichten. Eine Karte kann eine Strukturvorschau, die Formel, den Pfad, das Erstellungs- und Änderungsdatum, das Molekulargewicht, den LogP-Wert sowie eine an die Finder-Bezeichnungen angepasste Gestaltung enthalten.
- Das Raster bleibt auch dann nützlich, wenn die Dateinamen uneinheitlich sind, da AtomLens die chemischen Metadaten direkt auf der Karte anzeigt.
- Die Karten werden aktualisiert, sobald Metadaten und Vorschaubilder eintreffen.
- Wenn AtomLens noch keine unterstützten Chemie-Dateien gefunden hat, zeigt es eine eindeutige Meldung an, dass der Zustand leer ist, anstatt ein unerklärliches leeres Raster anzuzeigen.
Auswahl und Vorschau
Der „Local Molecule Files“-Browser unterstützt die Bedienung per Maus und Tastatur.
- Ein Klick für eine Datei,
Command-Klick zum Mehrfachauswahl,Shift-Klick für die Reichweiten undCommand-Aum alle sichtbaren Ergebnisse auszuwählen. - Doppelklick auf eine Karte, drücke
Return, oder nutzeOpen Selectedum die aktuelle Auswahl zu öffnen. - Presse
Spacefür die In-App-Vorschau, ohne die Datei in einem vollständigen Dokumentfenster zu öffnen. - Verwendung
Show in Finderwenn genau eine Datei ausgewählt ist oder die Schaltfläche „Teilen“ für die Standard-macOS-Freigabeziele. - Wähle „Verwaltetes Repository“ > „In verwaltetes Repository kopieren“, um Kopien ausgewählter lokaler Dateien in den von AtomLens verwalteten Speicher zu importieren.
- Wähle „Verwaltetes Repository“ > „In verwaltetes Repository verschieben…“, wenn du möchtest, dass AtomLens ausgewählte lokale Dateien importiert und anschließend die Originale in den Papierkorb verschiebt. AtomLens fragt vor dem Verschieben der Originale nach einer ausdrücklichen Bestätigung.
- Der Bereich „Lokale Dateien“ löscht niemals beliebige Dateien. Das Löschen ist nur für Einträge im verwalteten Repository möglich, deren Eigentümer „AtomLens“ ist.
„Spotlight“- und „Finder“-Bezeichnungen
„Local Molecule Files“ ist eng mit den Metadaten des macOS-Systems verknüpft.
- Mit Spotlight lassen sich chemische Bezeichnungen und Eigenschaften sowohl außerhalb von AtomLens als auch direkt im Browser suchen.
- Finder-Bezeichnungen sind auf den Karten sichtbar, stehen als Filter zur Verfügung und können über die untere Symbolleiste bearbeitet werden.
- Bestehende nicht farbige Finder-Tags bleiben erhalten, wenn du die Bezeichnungen von AtomLens änderst.
- Die „Schnellansicht“-Vorschau funktioniert im Finder und im AtomLens-Browser-Workflow.
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