Explorar archivos locales
«Local Molecule Files» es la forma más rápida de buscar en grandes bibliotecas químicas locales sin tener que abrir los archivos uno por uno en el Finder.
El navegador de Local Molecule Files empieza con controles de búsqueda, «solo reacciones», etiqueta del Finder, ordenar y ordenar por. Los resultados aparecen como tarjetas en la cuadrícula central, y la barra de acciones de la parte inferior incluye opciones para editar etiquetas, compartir, «Vista rápida», mostrar en el Finder, transferir al repositorio gestionado y «Abrir selección». Haz clic con la tecla Control pulsada sobre una tarjeta para acceder a las mismas acciones desde su menú contextual.
Buscar y filtrar
Escribe el texto en el campo de búsqueda y pulsa Return o haz clic en Search para buscar por nombre de archivo y metadatos químicos indexados. AtomLens utiliza las claves químicas de Spotlight cuando están disponibles y, si faltan los metadatos más detallados o aún no se han actualizado, recurre a los nombres de archivo químicos compatibles.
- La opción «Mostrar solo reacciones» limita la cuadrícula a los archivos de reacciones indexados.
- Los botones de etiquetas del buscador, situados en la barra de filtros, limitan los resultados a las combinaciones de etiquetas que coinciden.
- Los controles de ordenación te permiten ordenar por fecha de modificación, fecha de creación, peso molecular o LogP, en orden ascendente o descendente.
Mensajes de estado
La barra de estado de la parte inferior muestra la operación activa del navegador. Un icono giratorio significa que AtomLens sigue trabajando; aparece una barra de progreso azul cuando la operación actual alcanza una fracción determinada, como el escaneo del repositorio gestionado, la reconstrucción del índice de texto, la validación del índice de moléculas en segundo plano o la eliminación del repositorio. Los ejemplos que aparecen a continuación utilizan recuentos de muestras y términos de búsqueda; los números y las etiquetas de tu navegador reflejan la búsqueda actual.
Búsqueda en archivos locales
| Ejemplo de mensaje | Qué significa |
|---|---|
Collecting molecule file references (1,240)...Collecting reaction file references for "Aspirin" (42)... | AtomLens está recopilando referencias a archivos locales de Spotlight. |
Indexed chemistry metadata looks incomplete (12). Falling back to supported filenames... | Spotlight ha devuelto muy pocos resultados de metadatos químicos, así que AtomLens inicia una búsqueda alternativa basada en el nombre del archivo para los formatos químicos compatibles. |
Collecting supported chemistry file references (320)...Collecting supported reaction file references for "Aspirin" (18)... | AtomLens está recopilando nombres de archivos compatibles porque los metadatos completos de Spotlight Chemistry están incompletos. |
Found 1,240 molecule files. Loading metadata...Found 320 supported chemistry files. Loading metadata... | La recopilación de referencias ha finalizado y AtomLens está a punto de cargar los metadatos de la tarjeta. |
Loading molecule metadata (350/1,240)... | AtomLens está enriqueciendo las fichas de resultados con metadatos químicos, fechas, etiquetas y valores listos para previsualizar. |
Showing cached results. Refreshing metadata (350/1,240)... | La caché de arranque en caliente se ve mientras AtomLens actualiza el mismo conjunto de resultados de «Archivos locales» en segundo plano. |
Loaded 1,240 molecule files.Loaded 42 reaction files. | La búsqueda activa en «Archivos locales» ha terminado. |
Local Files search could not start.Local Files search could not start filename fallback. | No se ha podido iniciar la consulta de Spotlight ni la consulta alternativa. |
Búsqueda en el repositorio gestionado
| Ejemplo de mensaje | Qué significa |
|---|---|
Scanning Managed Repository files...Scanning Managed Repository files (40,750/66,315, 61%)... | AtomLens está leyendo las referencias del repositorio, aplicando los filtros del repositorio y preparando el conjunto de resultados. Cuando hay recuentos disponibles, la barra de progreso muestra la misma fracción. |
Updating Managed Repository text index...Updating Managed Repository text index (40,750/66,315, 61%)... | AtomLens actualiza el índice de texto local en segundo plano. Las búsquedas utilizan los registros ya indexados, y los resultados se actualizan a medida que hay más registros disponibles. Solo hay que volver a indexar los registros que hayan cambiado. |
Search results may be incomplete while the text index updates.Text index update paused or incomplete. Search results may be incomplete. | Algunos registros aún no se pueden buscar. Usa el icono de «Pausar» o «Reanudar» que hay junto al texto de estado para controlar la indexación. Los resultados confirmados siguen estando disponibles para la búsqueda, y al reanudar se continúa desde el progreso guardado. El índice de texto se guarda localmente en cada dispositivo, no en iCloud. |
Loading repository metadata (350/1,240)... | Las referencias del repositorio correspondientes se están convirtiendo en fichas visibles en el navegador. |
Showing cached repository results. Refreshing metadata (350/1,240)... | Se muestra una vista predeterminada en caché del repositorio gestionado mientras AtomLens actualiza los metadatos del estado actual del repositorio. |
Loaded 1,240 Managed Repository files.Loaded 42 Managed Repository reaction files.Loaded 12 Managed Repository Markush structures. | Se ha completado la búsqueda activa en el repositorio gestionado. |
Actividad del repositorio en segundo plano
| Ejemplo de mensaje | Qué significa |
|---|---|
Checking Managed Repository changes... | El observador del repositorio comprueba si hay cambios en las raíces de contenido y metadatos, incluidas las raíces respaldadas por iCloud cuando la sincronización está activada. |
Validating molecule search index... | AtomLens está comprobando o reconstruyendo el índice de búsqueda de moléculas que se usa para buscar compuestos químicos en el repositorio. |
Validating molecule search index (35%, scanning 23,000/66,315)...Validating molecule search index (72%, indexing 8,000/12,000)... | La fase de validación incluye el recuento de elementos. |
Validating molecule search index (92%, writing cache)...Validating molecule search index (96%, updating cache)... | La fase de validación tiene un porcentaje, pero no indica el número de elementos. |
Uploading Managed Repository changes to iCloud...Downloading Managed Repository changes from iCloud... | El monitor de actividad de sincronización macOS iCloud informa sobre la actividad de subida o descarga del repositorio. |
Otros resultados de la barra de estado
Preparing to delete 12 Managed Repository entries...,Deleting Managed Repository entries..., yDeleting Managed Repository entries (8/12)...aparecen cuando se borra solo del repositorio.Showing 500 of 1,240 files (700 loaded).Aparece cuando la cuadrícula muestra un subconjunto de los resultados coincidentes mientras aún se está realizando el seguimiento de las entradas cargadas.- Los mensajes de resultado vacío pueden tener un aspecto similar a este:
No indexed molecule or reaction files found.,No molecule files found.,No reaction files found.,No Markush structures found.,No Managed Repository files found., oNo matching molecule files found.. - Los resúmenes de los filtros activos pueden tener este aspecto:
Active filters: Reactions only | Text: "Aspirin" | Labels: RedoActive filters: Markush structures only. IdlePuede aparecer cuando el modelo de búsqueda subyacente se ha detenido y no hay ningún estado de resultado de búsqueda activo.
Fichas de resultados
Las fichas del navegador muestran más que simples miniaturas. Una ficha puede incluir una vista previa de la estructura, la fórmula, la ruta, las fechas de creación y modificación, el peso molecular, el LogP y un estilo adaptado a las etiquetas de Finder.
- La tabla sigue siendo útil incluso cuando los nombres de los archivos no son uniformes, ya que AtomLens muestra los metadatos químicos directamente en la ficha.
- Las fichas se actualizan a medida que llegan los metadatos y las miniaturas.
- Si AtomLens aún no ha encontrado archivos químicos compatibles, muestra un mensaje claro indicando que está vacío, en lugar de una cuadrícula en blanco sin explicación.
Selección y vista previa
El navegador «Local Molecule Files» admite flujos de trabajo con el ratón y el teclado.
- Un clic para un archivo,
Command-haz clic para seleccionar varios elementos,Shift-haz clic para ver los rangos, yCommand-Apara seleccionar todos los resultados visibles. - Haz doble clic en una ficha y pulsa
Return, o usaOpen Selectedpara abrir la selección actual. - Prensa
Spacepara usar la función «Vista rápida» desde la aplicación sin tener que abrir el archivo en una ventana de documento completa. - Uso
Show in Findercuando se seleccione exactamente un archivo, o el botón «Compartir» para los destinos de uso compartido estándar de macOS. - Usa «Repositorio gestionado» > «Copiar al repositorio gestionado» para importar copias de los archivos locales seleccionados al almacenamiento gestionado por AtomLens.
- Usa «Repositorio gestionado» > «Mover al repositorio gestionado...» cuando quieras que AtomLens importe los archivos locales seleccionados y, a continuación, mueva los originales a la papelera. AtomLens te pide confirmación explícita antes de mover los originales.
- El panel «Archivos locales» nunca borra archivos al azar. Solo se pueden borrar las entradas del repositorio gestionado que sean propiedad de AtomLens.
Etiquetas de Spotlight y Finder
Los archivos de moléculas locales están estrechamente vinculados a los metadatos del sistema macOS.
- Spotlight permite buscar identificadores y propiedades químicas tanto fuera de AtomLens como dentro del navegador.
- Las etiquetas del Finder se ven en las tarjetas, están disponibles como filtros y se pueden editar desde la barra de herramientas de abajo.
- Las etiquetas existentes de Finder que no son de color se conservan cuando cambias las etiquetas de AtomLens.
- Las vistas previas de «Quick Look» funcionan en el Finder y en el flujo del navegador AtomLens.
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