Ayuda de AtomLens 3.1

AtomLens convierte textos y archivos químicos compatibles en vistas interactivas de moléculas en 2D y 3D, así como en vistas de reacciones en 2D, identificadores calculados, propiedades y exportaciones que puedes compartir. Funciona con formatos habituales de moléculas y reacciones, admite la introducción directa de texto, como SMILES, InChI, Reaction SMILES y RInChI, y puede convertir los nombres IUPAC compatibles en estructuras renderizadas.

Más allá de una simple ventana de documento, AtomLens se integra con macOS para que los archivos químicos sigan siendo útiles en el Finder, Quick Look, Spotlight, los archivos de moléculas locales y el repositorio gestionado. Usa el repositorio gestionado cuando quieras que los archivos químicos que pertenecen a AtomLens sigan estando disponibles localmente y se puedan sincronizar a través de iCloud cuando la sincronización del repositorio esté activada.

1. Si no tienes archivos de química a mano, usa la pantalla de bienvenida o ve a Ajustes > Repositorio gestionado > Añadir estructuras y reacciones de ejemplo para importar los ejemplos incluidos.
2. Abre un archivo de química o selecciona «Editar fuente de estructura» en la barra de herramientas del documento, pega el texto compatible y selecciona «Aplicar y renderizar».
3. Usa «Examinar archivos locales» cuando quieras buscar, con la ayuda de Spotlight, entre los archivos de química que ya tienes en tu Mac.
4. Usa la opción «Guardar en el repositorio gestionado...» cuando quieras que AtomLens guarde una copia gestionada en el repositorio gestionado.
5. Abre «Configuración» si quieres cambiar el comportamiento de inicio, la sincronización del repositorio o el acceso al entorno de pruebas.

AtomLens incluye estructuras y reacciones de ejemplo para que puedas probar la app al instante sin tener que descargar ni buscar primero archivos de química. El conjunto contiene 20 estructuras de la «Entidad del mes» de ChEBI y 20 ejemplos de reacciones derivadas de Rhea, incluidas entradas de reacciones almacenadas a través de RInChI para su importación al repositorio.

1. La primera vez que lo abras, deja marcada la opción «Añadir estructuras y reacciones de ejemplo» en la pantalla de bienvenida y, a continuación, pulsa «Continuar».
2. Si ya no aparece la pantalla de bienvenida, abre Ajustes > Repositorio gestionado y selecciona «Añadir estructuras y reacciones de ejemplo».
3. Abre «Archivo» > «Repositorio gestionado...» para explorar los ejemplos importados y, a continuación, usa el campo de búsqueda del repositorio o el filtro «solo reacciones» para acotar los resultados.
4. Abre una ficha de estructura o de reacción para ver la representación, las propiedades calculadas, los identificadores y los participantes en la reacción.

AtomLens compara las claves InChIKeys de estructura y las claves RInChIKeys de reacción largas durante la importación, así que, si vuelves a importar los ejemplos, se omiten las entradas que ya están presentes en lugar de añadir duplicados.

AtomLens es una aplicación macOS que da prioridad a los datos locales. El análisis, la visualización, la exportación y la extracción se realizan en tu Mac. Cuando la sincronización del repositorio está activada, el contenido y los metadatos del repositorio gestionado pasan por iCloud cuando está disponible. Las etiquetas del Finder, los metadatos de Spotlight y las vistas previas de Quick Look están integradas para que AtomLens siga siendo útil incluso fuera de la ventana principal del documento.