Aide AtomLens 3.1
Ouvre, explore, dessine, numérise et organise tes cours de chimie sur Mac et iPad. Choisis le guide adapté à ton appareil ; les thèmes abordés sur Mac sont répertoriés ci-dessous.
AtomLens transforme les textes et fichiers chimiques pris en charge en vues moléculaires interactives en 2D et 3D, en vues de réactions en 2D, en identifiants calculés, en propriétés et en fichiers exportables à partager. Il prend en charge les formats courants de molécules et de réactions, permet la saisie directe de texte (comme SMILES, InChI, Reaction SMILES et RInChI) et peut convertir les noms IUPAC pris en charge en structures rendues.
Au-delà d'une simple fenêtre de document, AtomLens s'intègre à macOS pour que les fichiers de chimie restent accessibles dans le Finder, Quick Look, Spotlight, les fichiers de molécules locaux et le référentiel géré. Utilise le référentiel géré quand tu veux que les fichiers de chimie appartenant à AtomLens restent disponibles localement et puissent se synchroniser via iCloud lorsque la synchronisation du référentiel est activée.
Guide de démarrage rapide
- Si tu n'as pas de fichiers de chimie sous la main, utilise l'écran d'accueil ou va dans Paramètres > Référentiel géré > Ajouter des exemples de structures et de réactions pour importer les exemples fournis.
- Ouvre un fichier de chimie, ou clique sur « Modifier la source de la structure » dans la barre d'outils du document, colle le texte pris en charge, puis clique sur « Appliquer et générer ».
- Utilisez l’option « Parcourir les fichiers locaux » lorsque vous souhaitez effectuer une recherche via Spotlight parmi les fichiers de chimie déjà présents sur votre Mac.
- Utilisez l’option « Enregistrer dans le référentiel géré… » lorsque vous souhaitez que AtomLens conserve une copie gérée dans le référentiel géré.
- Ouvre les paramètres si tu veux modifier le comportement au démarrage, la synchronisation du référentiel ou l'accès au bac à sable.
Guide de démarrage rapide avec des exemples
AtomLens comprend des exemples de structures et de réactions pour que tu puisses tester l'appli tout de suite, sans avoir à télécharger ou à rechercher au préalable des fichiers de chimie. L'ensemble contient 20 structures « Entité du mois » de ChEBI et 20 exemples de réactions issues de Rhea, y compris des entrées de réactions enregistrées via RInChI en vue de leur importation dans un référentiel.
- Lors du premier démarrage, laisse l'option « Ajouter des exemples de structures et de réactions » cochée sur l'écran d'accueil, puis clique sur « Continuer ».
- Si l'écran d'accueil ne s'affiche plus, va dans Paramètres > Référentiel géré et sélectionne « Ajouter des exemples de structures et de réactions ».
- Ouvre « Fichier > Référentiel géré... » pour parcourir les exemples importés, puis utilise le champ de recherche du référentiel ou le filtre « Réactions uniquement » pour affiner les résultats.
- Ouvre une fiche de structure ou de réaction pour consulter la représentation, les propriétés calculées, les identifiants et les réactifs.
AtomLens compare les clés InChIKeys de structure et les clés RInChIKeys de réaction longues lors de l'importation ; ainsi, quand tu réimportes les exemples, les entrées déjà présentes sont ignorées au lieu d'être dupliquées.
Guides pratiques
Découvre la fenêtre principale du logiciel, affiche les structures collées, examine les métadonnées et exporte ou partage les résultats relatifs aux molécules.
Dessine des molécules, des réactions et des requêtes de recherche à l'aide d'atomes, de liaisons, de cycles, de modèles et de vérifications chimiques adaptées aux débutants.
Trouve les noms chimiques et les schémas de structure imprimés grâce à l'assistance IA intégrée à l'appareil, valide les structures toi-même, vérifie les aperçus et retourne sur chaque page PDF.
Recherche dans les fichiers Chemistry locaux, filtre et trie les résultats, prévisualise-les avec Quick Look et utilise les étiquettes du Finder.
Découvre comment fonctionne le référentiel géré sur macOS, comment se déroule la synchronisation sur iCloud et ce qui se passe quand la synchronisation est désactivée.
Consultez les volets « Paramètres », l'accès au bac à sable, l'intégration à Spotlight et au Finder, la configuration de AtomLens MCP, ainsi que les étapes courantes de dépannage.
Guides de référence
Consultez les sections sur la similarité chimique et la recherche par sous-structure, les formats pris en charge, les workflows d'extraction, les fonctionnalités de réaction, les notes CXSMILES et Markush, ainsi que les attentes en matière de conversion bidirectionnelle.
Consultez les termes de chimie, les identifiants, les propriétés calculées, les concepts de réaction et les formats de fichiers utilisés dans AtomLens.
Découvre les palettes de couleurs des atomes en 3D, leurs utilisations prévues, ainsi que les mentions relatives à la licence open source et à l'attribution que AtomLens respecte.
Notes d'assistance
AtomLens est une application macOS qui privilégie le local. L'analyse, la visualisation, l'exportation et l'extraction s'effectuent sur ton Mac. Lorsque la synchronisation du référentiel est activée, le contenu et les métadonnées du référentiel géré transitent par iCloud quand c'est possible. Les étiquettes du Finder, les métadonnées Spotlight et les aperçus Quick Look sont intégrés pour que AtomLens reste utile même en dehors de la fenêtre principale du document.
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