Begriffe aus der Chemie

Lerne, was Identifikatoren, berechnete Eigenschaften und Ergebnisse der Struktursuche sind.

Namen und Bezeichner

SMILES beschreibt Atome und Bindungen als Text; das isomere SMILES enthält unterstützte Stereochemie. CXSMILES fügt Anmerkungen hinzu, die in einfacheren Formaten möglicherweise nicht erhalten bleiben. InChI ist ein standardisierter Strukturbezeichner, und InChIKey ist dessen kompakter Schlüssel. RInChI beschreibt Reaktionen.

Ein IUPAC-Name beschreibt eine chemische Struktur. Ein erfolgreich analysierter oder generierter Name ist nicht unbedingt der eindeutige bevorzugte IUPAC-Name. Die Identitäten „Standard“ und „Fixed-H InChI“ erfassen unterschiedliche Details zu Wasserstoffatomen und Tautomeren; bei der Überprüfung des gescannten Namens müssen beide übereinstimmen.

Berechnete Eigenschaften

Die Formel zählt die Elemente. Molekulargewicht, Molmasse und monoisotopische Masse basieren auf unterschiedlichen Massenkonventionen. LogP schätzt die Verteilung, TPSA steht für die topologische polare Oberfläche, und die Anzahl der Wasserstoffbrücken-Donoren und -Akzeptoren beschreibt mögliche Bindungsstellen.

Drehbare Bindungen und die Ringanzahl geben einen Überblick über die Topologie. Die „Fünf-Regel“ ist eine Screening-Heuristik und keine Vorhersage hinsichtlich Sicherheit, Wirksamkeit oder Eignung für die Anwendung. Die Werte hängen von der analysierten Struktur und der Berechnungsmethode ab.

Suchergebnisse für Chemikalien

Die Ähnlichkeit ordnet Molekül-Fingerabdrücke nach dem Tanimoto-Wert von 0 bis 1. Ein hoher Wert beweist nicht, dass die Suchanfrage in einem Ergebnis enthalten ist. Violette Markierungen zeigen gemeinsame Bereiche an, die innerhalb einer kurzen Zeitspanne gefunden wurden; es kann ein größerer gemeinsamer Bereich existieren. Ergebnisse ohne Markierung behalten ihren Wert und ihre Rangfolge bei.

Die Substruktur-Suche prüft, ob Atome und Bindungen enthalten sind, und hebt die Übereinstimmung rot hervor. MCIS/Target vergleicht gemeinsame Atome mit der Zielgröße; genauere Übereinstimmungen erhalten in der Regel eine höhere Bewertung. Diese Suchen beziehen sich auf Moleküle aus dem Repository, nicht auf ganze Reaktionen.