化学术语

了解标识符、计算属性以及结构搜索结果。

名称和标识符

SMILES 以文本形式描述原子和化学键；其异构体 SMILES 包含受支持的立体化学信息。CXSMILES 添加了较简单格式可能无法保留的注释。InChI 是一种标准化的结构标识符，而 InChIKey 是其紧凑型键值。RInChI 描述化学反应。

IUPAC名称用于描述化学结构。成功解析或生成的名称未必就是唯一的“首选IUPAC名称”。标准标识符和固定氢（Fixed-H）InChI标识符分别反映了不同的氢原子/互变异构体细节；扫描名称验证要求两者一致。

计算属性

公式用于统计元素数量。分子量、摩尔质量和单同位素质量采用不同的质量计算标准。LogP 用于估算分配系数，TPSA 指拓扑极性表面积，而氢键供体/受体计数则描述了可能的键合位点。

可旋转键和环数可概括分子拓扑结构。“五规则”是一种筛选启发式方法，并非对安全性、有效性或适用性的预测。具体数值取决于解析出的结构和计算方法。

化学搜索结果

相似性根据0到1之间的Tanimoto得分对分子指纹进行排序。高得分并不证明查询分子包含在结果中。紫色高亮部分显示在短时间内找到的共同区域；可能还存在更大的共同区域。未被高亮显示的结果仍保留其得分和排名。

子结构搜索会检查原子和键的包含关系，并将匹配部分以红色高亮显示。MCIS/Target 会将共享原子与目标尺寸进行比较；匹配度越高，排名通常越靠前。这些搜索操作针对的是数据库中的分子，而非整个反应。