“浏览”和“文件”
利用“托管存储库”、“文件”集成和标签，快速查找已保存的化学信息。
托管存储库的搜索内容
“托管存储库”是 AtomLens 所属化学数据的主要 iPad 工作区。其“搜索”按钮可对已保存的名称、化学式、标识符、化学文本、标签和源文件名进行索引全文本搜索。它不会像桌面风格的 Spotlight 那样对整个设备进行搜索。
- 按回车键或点击“搜索”按钮，可按相关性对索引结果进行排序；清除搜索后，将恢复之前的排序方式。
- 仅使用“反应”、“马库什”和“3D”过滤器以及标签过滤器来缩小仓库范围。
- 按相关性、添加时间、修改时间、创建时间、名称、类型、分子量或LogP排序。
- 点击“按查询结构搜索”以打开完整的 Ketcher 绘图编辑器，绘制或编辑可视化查询，并选择“子结构”或“相似性”。您还可以从当前分子或导入的 MOL、SDF、SMILES 或 CXSMILES 文本中获取编辑器的初始数据。
- 每张分子卡的结构搜索菜单均可根据选定的Tanimoto阈值查找相似结构，或将该分子用作子结构查询。
从 PubChem 导入
在“库”工具栏中点击 PubChem。 输入名称、同义词、化合物 ID（CID）、物质 ID（SID）、化学式、SMILES、InChI 或 InChIKey，然后点击“搜索”。 系统会自动识别常见的输入格式；当输入内容存在歧义时，请使用“搜索”功能。
查看结构卡片，然后点击所需化合物的“导入”按钮。AtomLens 使用 PubChem 作为其库显示名称，并保留原始 SDF 及其属性。“加载更多结果”将调出另一页。导入操作是逐个进行的；不支持多选或批量导入。匹配的查询文本会在可见的名称、CID 和化学式中被高亮显示；其他 PubChem 同义词中的匹配项可能无法显示。
搜索操作会通过互联网将您的查询发送至 PubChem。预览结果在本地生成。搜索和下载共享一个分批请求队列，当 PubChem 忙碌时会暂停。取消操作会终止待处理的请求；但已经开始的存储库写入操作会安全地完成。
“文件”应用集成
AtomLens 通过“文件”功能，利用文件提供程序域来暴露其内部库。这使得已保存的结构和提取结果在 iPad 工作流中拥有了一个稳定的存储位置。
在每台设备的“设置”>“受管库”中，使用同一 Apple 账号启用通过 iCloud 同步化学文件的功能。AtomLens 会通过您的私人 iCloud 存储空间同步受管的化学内容、标签、收藏项和最近使用记录。
如果您在“设置”中关闭了 iCloud 同步功能，此 iPad 仍会通过本地“受管存储库”提供基于存储库的“保存”、“提取”、“浏览”、“文件”、“快速查看”和搜索功能。
- 应用于 AtomLens 拥有的文件的文件标签会显示在“受管存储库”中。
- 文件可以直接重新打开由 AtomLens 拥有的文件，将其重新导入该应用。
预览、分享与期待
AtomLens 支持在 iPad 上对受支持的化学文件进行系统“快速查看”预览。在 AtomLens 中，受管存储库卡片会显示示意图缩略图和化学元数据，以便快速浏览和分享。
- 当您想将已保存的文件发送至另一款应用时，请使用“库”卡片中的“分享”功能。
- 在“文件”中，您可以“快速查看”AtomLens拥有的文件，而无需在应用中重新打开它们。
- 与 Mac 相比，iPad 的系统搜索范围更窄。AtomLens 会将“托管存储库”中的项目提交给 Core Spotlight，但不会提交设备上任意化学文件。
- 从 iCloud 接收到的更改会更新“托管存储库”及其系统集成。大型库的初始同步可能需要一段时间；在同步过程中，请检查存储库状态。
- 跨设备计时仍然取决于 iCloud 的传递，以及 AtomLens 或 Files 何时再次唤醒。