Explorar y archivos

Usa el repositorio gestionado, la integración con archivos y las etiquetas para encontrar rápidamente las fórmulas químicas guardadas.

Qué busca el repositorio gestionado

Managed Repository es el espacio de trabajo principal de iPad para la información química de AtomLens. Su botón «Buscar» realiza una búsqueda de texto completo indexada entre los nombres guardados, fórmulas, identificadores, texto químico, etiquetas y nombres de archivos de origen. No realiza una búsqueda tipo Spotlight, como la del escritorio, en todo el dispositivo.

• Pulsa Intro o toca «Buscar» para ordenar los resultados indexados por relevancia; si borras la búsqueda, se restablecerá el orden anterior.
• Usa los filtros «Solo reacciones», «Solo Markush», «Solo 3D» y los filtros de etiquetas para acotar la búsqueda en el repositorio.
• Ordena por relevancia, fecha de incorporación, modificación o creación, nombre, tipo, peso molecular o LogP.
• Pulsa en «Buscar por estructura de consulta» para abrir el editor de dibujos completo de Ketcher, dibujar o editar una consulta visual y elegir entre «Subestructura» o «Similitud». También puedes utilizar la molécula actual o un texto importado en formato MOL, SDF, SMILES o CXSMILES como punto de partida para el editor.
• El menú de búsqueda de estructuras de cada ficha de molécula te permite encontrar estructuras similares con un umbral de Tanimoto que elijas o utilizar esa molécula como consulta de subestructura.

Importar desde PubChem

Pulsa en PubChem en la barra de herramientas de la biblioteca. Introduce un nombre, un sinónimo, un identificador de compuesto (CID), un identificador de sustancia (SID), una fórmula, SMILES, InChI o InChIKey, y luego pulsa en «Buscar». El sistema detecta automáticamente los formatos de entrada más comunes; usa la opción «Buscar como» cuando lo que introduzcas sea ambiguo.

Echa un vistazo a las fichas de estructura y pulsa en «Importar» en el compuesto que quieras. AtomLens usa el nombre «PubChem» como nombre de visualización en la biblioteca y conserva el SDF original y sus propiedades. Al pulsar «Cargar más resultados» se abre otra página. Las importaciones son individuales; no hay selección múltiple ni importación masiva. El texto de la consulta que coincide aparece resaltado en los nombres visibles, los CID y las fórmulas; es posible que las coincidencias en otros sinónimos de PubChem no sean visibles.

Al hacer una búsqueda, tu consulta se envía a PubChem a través de Internet. Las vistas previas se generan localmente. Las búsquedas y las descargas comparten una cola de solicitudes regulada y se detienen cuando PubChem está ocupado. Al cancelar, se detiene una solicitud pendiente; una escritura en el repositorio que ya haya comenzado se completa de forma segura.

Integración con la app «Archivos»

AtomLens expone su biblioteca interna a través de «Archivos» utilizando un dominio de proveedor de archivos. Esto proporciona a las estructuras guardadas y a los resultados de la extracción un lugar estable en el flujo de trabajo de iPad.

Activa la sincronización de archivos químicos a través de iCloud en «Ajustes > Repositorio gestionado» en cada dispositivo, utilizando la misma cuenta de Apple. AtomLens sincroniza el contenido químico gestionado, las etiquetas, los favoritos y el uso reciente a través de tu almacenamiento privado iCloud.

Si desactivas la sincronización iCloud en Ajustes, esta versión iPad mantiene disponibles las funciones de Guardar, Extraer, Explorar, Archivos, Vista rápida y Búsqueda, respaldadas por el repositorio, a través del repositorio gestionado local.

• Las etiquetas aplicadas a los archivos de AtomLens aparecen en el repositorio gestionado.
• Los archivos que pertenecen a AtomLens se pueden volver a abrir directamente en la app.

Avances, intercambio de opiniones y expectativas

AtomLens es compatible con las vistas previas de «Quick Look» del sistema para los archivos químicos compatibles en iPad. Las fichas del repositorio gestionado muestran miniaturas y metadatos químicos dentro de AtomLens para que puedas echar un vistazo rápido y compartir el contenido.

• Usa la opción «Compartir» desde la ficha de un repositorio cuando quieras enviar un archivo guardado a otra aplicación.
• Desde «Archivos», puedes echar un vistazo rápido a los archivos de AtomLens sin tener que volver a abrirlos en la app.
• La cobertura de búsqueda del sistema es más limitada en el iPad que en el Mac. El AtomLens envía los elementos del repositorio gestionado a Core Spotlight, pero no todos los archivos de química que haya en el dispositivo.
• Los cambios recibidos de iCloud actualizan el repositorio gestionado y sus integraciones con el sistema. La sincronización inicial de una biblioteca grande puede tardar un rato; comprueba el estado del repositorio mientras se lleva a cabo.
• La sincronización entre dispositivos sigue dependiendo de la entrega de iCloud y de cuándo se vuelva a activar AtomLens o Files.