Durchsuchen und Dateien

Nutze das verwaltete Repository, die Datei-Integration und Tags, um gespeicherte chemische Formeln schnell zu finden.

Was das Managed Repository durchsucht

„Managed Repository“ ist der primäre iPad-Arbeitsbereich für chemische Daten, die zu AtomLens gehören. Über die Schaltfläche „Suchen“ kannst du eine indizierte Volltextsuche in gespeicherten Namen, Formeln, Kennungen, chemischen Texten, Tags und Quelldateinamen durchführen. Es findet keine Spotlight-Suche im Desktop-Stil auf dem gesamten Gerät statt.

• Drücke die Eingabetaste oder tippe auf „Suchen“, um die indizierten Treffer nach Relevanz zu sortieren; wenn du die Suche löschst, wird die vorherige Sortierung wiederhergestellt.
• Nutze die Filter „Nur Reaktionen“, „Nur Markush“, „Nur 3D“ und die Tag-Filter, um das Repository einzugrenzen.
• Sortiere nach Relevanz, Hinzufügungs-, Änderungs- oder Erstellungsdatum, Name, Typ, Molekulargewicht oder LogP.
• Tippe auf „Suche nach Abfragestruktur“, um den vollständigen Ketcher-Zeicheneditor zu öffnen, eine visuelle Abfrage zu zeichnen oder zu bearbeiten und „Teilstruktur“ oder „Ähnlichkeit“ auszuwählen. Du kannst den Editor auch mit dem aktuellen Molekül oder importierten MOL-, SDF-, SMILES- oder CXSMILES-Text vorbelegen.
• Über das Menü zur Struktursuche jeder Molekülkarte kannst du ähnliche Strukturen bei einem gewählten Tanimoto-Schwellenwert finden oder dieses Molekül als Teilstruktur-Suchbegriff verwenden.

Import aus PubChem

Tippe in der Symbolleiste „Bibliothek“ auf „PubChem“. Gib einen Namen, ein Synonym, eine Verbindungs-ID (CID), eine Stoff-ID (SID), eine Formel, „SMILES“, „InChI“ oder „InChIKey“ ein und tippe dann auf „Suchen“. Das System erkennt gängige Eingabeformate automatisch; nutze die Suchfunktion, wenn eine Eingabe mehrdeutig ist.

Schau dir die Strukturkarten an und tippe bei der gewünschten Verbindung auf „Importieren“. AtomLens verwendet den Namen „PubChem“ als Anzeigenamen in der Bibliothek und behält die ursprüngliche SDF-Datei sowie deren Eigenschaften bei. Mit „Weitere Ergebnisse laden“ wird eine weitere Seite aufgerufen. Importe erfolgen einzeln; eine Mehrfachauswahl oder ein Massenimport ist nicht möglich. Übereinstimmungen mit dem Suchtext werden in sichtbaren Namen, CIDs und Formeln hervorgehoben; Übereinstimmungen in anderen PubChem-Synonymen sind möglicherweise nicht sichtbar.

Bei der Suche wird deine Anfrage über das Internet an PubChem gesendet. Vorschauen werden lokal gerendert. Suchvorgänge und Downloads nutzen gemeinsam eine abgetaktete Anforderungswarteschlange und werden angehalten, wenn PubChem ausgelastet ist. Mit „Abbrechen“ wird eine ausstehende Anfrage gestoppt; ein bereits begonnener Schreibvorgang im Repository wird sicher zu Ende geführt.

Integration der „Dateien“-App

AtomLens stellt seine interne Bibliothek über „Files“ mithilfe einer „File Provider“-Domäne zur Verfügung. Dadurch erhalten gespeicherte Strukturen und Extraktionsergebnisse einen festen Platz im iPad-Workflow.

Aktiviere die Synchronisierung von Chemiedateien über iCloud unter „Einstellungen > Verwaltetes Repository“ auf jedem Gerät, wobei du denselben Apple-Account verwenden musst. AtomLens synchronisiert verwaltete Chemieinhalte, Tags, Favoriten und zuletzt verwendete Einträge über deinen privaten iCloud-Speicher.

Wenn du die iCloud-Synchronisierung in den Einstellungen deaktivierst, stehen auf diesem iPad die auf dem Repository basierenden Funktionen „Speichern“, „Extrahieren“, „Durchsuchen“, „Dateien“, „Schnellansicht“ und „Suchen“ weiterhin über das lokale verwaltete Repository zur Verfügung.

• Datei-Tags, die auf Dateien von AtomLens angewendet wurden, werden im verwalteten Repository angezeigt.
• Dateien, die AtomLens gehören, können direkt wieder in der App geöffnet werden.

Vorschauen, Teilen und Erwartungen

AtomLens unterstützt die „Quick Look“-Vorschau für unterstützte Chemie-Dateien in iPad. Die Karten im verwalteten Repository zeigen in AtomLens Miniaturansichten und Metadaten zu den chemischen Formeln an, was das schnelle Durchsehen und Teilen erleichtert.

• Nutze die Funktion „Teilen“ auf einer Repository-Karte, wenn du eine gespeicherte Datei an eine andere App senden möchtest.
• Über „Dateien“ kannst du dir Dateien, die AtomLens gehören, im Schnellansicht-Modus ansehen, ohne sie erneut in der App öffnen zu müssen.
• Die Suchabdeckung des Systems ist bei iPad geringer als bei Mac. AtomLens stellt Elemente aus dem Managed Repository für Core Spotlight bereit, jedoch nicht jede beliebige Chemie-Datei auf dem Gerät.
• Änderungen, die von iCloud eingehen, aktualisieren das verwaltete Repository und dessen Systemintegrationen. Die erste Synchronisierung einer großen Bibliothek kann eine Weile dauern; überprüfe den Status des Repositorys, während der Vorgang läuft.
• Die geräteübergreifende Zeitsteuerung hängt weiterhin von der Übertragung von iCloud ab und davon, wann AtomLens oder Files wieder aktiv wird.