Schnellstart

Fang mit den mitgelieferten Beispielen an, öffne eine Datei, analysiere den eingefügten chemischen Text, überprüfe die Struktur und speichere, teile oder extrahiere dann, was du brauchst.

Fang mit einer Datei oder eingefügtem Text an

Beginne in der Bibliothek. Mit „Öffnen“ wählst du eine Chemie-Datei aus dem Ordner „Dateien“ aus; „Neu > Struktur zeichnen“ oder „Neu > Strukturquelle eingeben“ startet einen isolierten Entwurf. Der Quelltext-Editor konvertiert außerdem unterstützte IUPAC-Bezeichnungen.

AtomLens wechselt automatisch zwischen Molekül- und Reaktions-Workflows, je nachdem, welchen Inhalt du öffnest.

• Der Import unterstützt Molekülformate wie MOL, SDF, SMILES, CXSMILES, InChI, MOL2, PDB, XYZ, CML und RGfile sowie Reaktionsformate wie Reaction SMILES, RInChI, RXN, RDF und Reaction CML.
• Wenn du Text einfügst, anstatt eine Datei zu öffnen, bleibt die Sitzung in AtomLens bearbeitbar, sodass du die Eingabe anpassen und erneut analysieren kannst.

Fang ohne eigene Dateien an

AtomLens enthält Beispielstrukturen und Reaktionen, sodass du den iPad-Workflow auch dann ausprobieren kannst, wenn du gerade keine Chemie-Dateien zur Hand hast.

Lass beim ersten Start auf dem Begrüßungsbildschirm die Option „Beispielstrukturen und -reaktionen hinzufügen“ ausgewählt und tippe auf „Weiter“. Öffne später die Einstellungen, wähle „Verwaltetes Repository“ aus und tippe auf „Beispielstrukturen und -reaktionen hinzufügen“.

• Das Beispielset enthält 20 „ChEBI Entity of the Month“-Strukturen und 20 von Rhea abgeleitete Reaktionen.
• Beispiele werden im Managed Repository gespeichert, wobei „iCloud“ verwendet wird, wenn die Repository-Synchronisierung aktiviert und verfügbar ist.
• AtomLens vergleicht beim Import die InChIKeys der Strukturen und die langen RInChIKeys der Reaktionen, sodass beim erneuten Import der Beispiele bereits vorhandene Einträge übersprungen werden.

Den Dokumenten-Arbeitsbereich lesen

Im Dokument-Arbeitsbereich stehen die Live-Arbeitsfläche und die Übersichts-Seitenleiste im Mittelpunkt. Mit „Strukturquelle bearbeiten“ oder „Reaktionsquelle bearbeiten“ öffnest du einen separaten Texteditor; mit „Struktur zeichnen“ oder „Reaktion zeichnen“ öffnest du einen separaten Zeicheneditor. Es gibt keine permanente Eingabe-Seitenleiste.

• Wähle „Ansicht“ > „Übersicht“, um die Details neben der Arbeitsfläche ein- oder auszublenden.
• Wenn eine Reaktion geladen ist, folgt die Übersichts-Seitenleiste dem aktuell ausgewählten Teilnehmer.

Beende die aktuelle Aufgabe

Wähle „Speichern“, wenn du eine einzelne, von AtomLens lesbare Chemiedatei im verwalteten Repository speichern möchtest. Wähle „Teilen“, wenn du die aktuelle Darstellung als SVG, PNG oder PDF an das System-Freigabefenster übergeben möchtest. Wähle „Extrahieren“, wenn die Quelle mehrere Datensätze enthält und du möchtest, dass AtomLens diese in einem Durchgang aufteilt oder zusammenfasst.

• „Bibliothek“ ist der Startbildschirm deines verwalteten Repositorys. Mit der Zurück-Schaltfläche in der Bibliothek kehrst du zu denselben Such- und Filteroptionen zurück. Wenn du „Dokumente öffnen“ wählst, werden deine geöffneten Registerkarten wiederhergestellt; beim Zurückkehren zur Bibliothek werden sie nicht geschlossen.
• Verwende den Filter „Nur Reaktionen“ im Managed Repository, wenn du dich auf Reaktionsdatensätze konzentrieren möchtest.
• Öffne die Hilfe über „Bibliothek“ oder „Mehr“ > „Hilfe“ in einem Dokument. Mit „Fertig“ kehrst du zum vorherigen Bildschirm zurück.