Guide de démarrage rapide

Commence par les exemples fournis, ouvre un fichier, analyse le texte chimique que tu as collé, examine la structure, puis enregistre, partage ou extrais ce dont tu as besoin.

Commence par un fichier ou du texte copié-collé

Commence par la bibliothèque. L'option « Ouvrir » te permet de sélectionner un fichier de chimie dans le dossier « Fichiers » ; « Nouveau > Dessiner une structure » ou « Nouveau > Saisir une structure » te permet de créer un brouillon isolé. L'éditeur de source convertit également les noms IUPAC pris en charge.

AtomLens bascule automatiquement entre les flux de travail « molécule » et « réaction » en fonction du contenu que tu ouvres.

• L'importation prend en charge les formats de molécules MOL, SDF, SMILES, CXSMILES, InChI, MOL2, PDB, XYZ, CML et RGfile, ainsi que les formats de réaction Reaction SMILES, RInChI, RXN, RDF et reaction CML.
• Si tu colles du texte au lieu d'ouvrir un fichier, AtomLens garde la session modifiable pour que tu puisses peaufiner la saisie et relancer l'analyse.

Commence sans tes propres fichiers

AtomLens contient des exemples de structures et de réactions pour que tu puisses découvrir le workflow iPad même si tu n'as pas de fichiers chimiques sous la main.

Lors du premier démarrage, laisse l'option « Ajouter des structures et des réactions d'exemple » sélectionnée sur l'écran d'accueil, puis appuie sur « Continuer ». Ensuite, ouvre « Paramètres », sélectionne « Référentiel géré », puis appuie sur « Ajouter des structures et des réactions d'exemple ».

• L'ensemble d'exemples comprend 20 structures « Entité du mois » de type ChEBI et 20 réactions dérivées de Rhea.
• Les exemples sont stockés dans le référentiel géré, en utilisant iCloud lorsque la synchronisation du référentiel est activée et disponible.
• AtomLens compare les InChIKeys de structure et les RInChIKeys de réaction longs lors de l'importation ; ainsi, quand tu réimports les exemples, les entrées déjà présentes sont ignorées.

Consulte l'espace de travail du document

L'espace de travail du document s'articule autour du canevas en temps réel et de la barre latérale « Aperçu ». Les options « Modifier la source de la structure » ou « Modifier la source de la réaction » ouvrent un éditeur de texte séparé ; les options « Dessiner la structure » ou « Dessiner la réaction » ouvrent un éditeur de dessin séparé. Il n'y a pas de barre latérale de saisie permanente.

• Sélectionne « Affichage » > « Aperçu » pour afficher ou masquer les détails à côté de la zone de travail.
• Si une réaction est chargée, la barre latérale de présentation suit le participant actuellement sélectionné.

Termine la tâche en cours

Utilise « Enregistrer » pour stocker un seul fichier chimique lisible par AtomLens dans le référentiel géré. Utilise « Partager » pour transmettre la représentation actuelle à la feuille de partage du système au format SVG, PNG ou PDF. Utilise « Extraire » lorsque la source contient plusieurs enregistrements et que tu veux que AtomLens les divise ou les résume en une seule opération.

• La « Bibliothèque » est l'écran d'accueil de ton référentiel géré. Le bouton « Retour » de la Bibliothèque te ramène à la même recherche et aux mêmes filtres. La fonction « Ouvrir les documents » réaffiche tes onglets ouverts ; revenir à la Bibliothèque ne les ferme pas.
• Utilisez le filtre « Réactions uniquement » dans le référentiel géré lorsque vous souhaitez vous concentrer sur les enregistrements de réactions.
• Ouvre l'aide depuis « Bibliothèque » ou « Plus > Aide » dans un document. « Terminé » te ramène à l'écran d'où tu viens.