रासायनिक संपादक
परमाणुओं, बंधों, छल्लों और अभिक्रिया चिह्नों के साथ एक सरल अणु, अभिक्रिया या खोज क्वेरी बनाएं।
AtomLens में SMILES टाइप करने या फ़ाइल खोलने के बजाय संरचनाएँ सीधे ड्रा करने के लिए एक रासायनिक संपादक शामिल है। लोकल मोलिक्यूल फ़ाइल्स और मैनेज्ड रिपॉजिटरी में, क्वेरी संरचना द्वारा खोज इस संपादक का उपयोग करती है ताकि आप वह संरचना ड्रा कर सकें जिसे आप खोजना चाहते हैं, फिर उपसंरचना या समानता चुनें।
शुरू करने के लिए आपको उन्नत रसायनशास्त्र का ज्ञान रखने की आवश्यकता नहीं है। इस आरेख को एक मानचित्र की तरह समझें: परमाणु बिंदु हैं, बंध उनके बीच की रेखाएँ हैं, छल्ले बंद लूप हैं, और अभिक्रिया तीर दिखाते हैं कि अभिकारक कैसे उत्पाद बनते हैं।
संपादक खोलें और अपना काम बनाए रखें।
- File > New एक खाली केमिकल ड्रॉइंग एडिटर खोलता है। सीधे ड्रॉ करें या Add Structure… का उपयोग करें। Save to Managed Repository… ड्रॉइंग को एक प्रबंधित रसायन प्रविष्टि के रूप में संग्रहीत करता है।
- Add Structure… मौजूदा अणु या अभिक्रिया को संपादित करते समय और क्वेरी एडिटर में भी उपलब्ध है। मोलिक्यूल ब्राउज़र से कोई संरचना चुनें, एक संरचना फ़ाइल चुनें, या समर्थित रासायनिक नाम या संरचना पाठ दर्ज करें। मौजूदा ड्राइंग के बगल में जोड़ रखने के लिए कैनवास पर क्लिक या टैप करें। Undo जोड़ को हटा देता है; रद्द करने पर ड्राइंग अपरिवर्तित रहती है। ब्राउज़र और फ़ाइल चयन अपनी सामग्री को ड्राफ़्ट में कॉपी कर लेते हैं। पूरे अभिक्रियाएँ अपनी भूमिकाएँ और लेआउट बनाए रखती हैं, लेकिन इन्हें अणु-खोज क्वेरीज़ के रूप में उपयोग नहीं किया जा सकता।
- मौजूदा दस्तावेज़ से, Draw Structure या Draw Reaction अपनी ही चलने योग्य, आकार बदलने योग्य Mac विंडो में एक चरणबद्ध संपादन खोलता है। इसे पुनःस्थित करने के लिए शीर्षक पट्टी को खींचें। संकीर्ण चौड़ाई पर बटन समूहों के बीच शीर्ष और नीचे के उपकरण पट्टी अतिरिक्त पंक्तियों में लपेट जाते हैं, जिससे सभी उपकरण पट्टी नियंत्रण अपने सामान्य आकार में दिखाई देते रहते हैं; निरीक्षक लंबवत स्क्रॉल होता है, और रद्द करें और संरचना का उपयोग (या प्रतिक्रिया का उपयोग) नीचे ही रहते हैं। 'संरचना का उपयोग करें' या 'प्रतिक्रिया का उपयोग करें' स्रोत दस्तावेज़ को अपडेट करता है; रद्द करने या संपादक को बंद करने पर यह अपरिवर्तित रहता है। संपादक को फिर से खोलने पर मौजूदा मसौदा सामने आ जाता है। स्रोत दस्तावेज़ को बंद करने पर उसका संपादक भी बंद हो जाता है। जब आप एक प्रति रखना चाहते हैं तो अपडेट किए गए दस्तावेज़ को सहेजें या निर्यात करें।
- क्वेरी संरचना के अनुसार खोज एक रिपॉजिटरी अणु खोज के लिए वही संपादक खोलती है। समानता या उपसंरचना चुनें और खोजें। खोजने पर क्वेरी को रिपॉजिटरी प्रविष्टि के रूप में सहेजा नहीं जाता।
- iPad पर, New > Draw Structure in Library चुनें या Add > Draw New Structure दस्तावेज़ में चुनें। Cancel ड्राफ़्ट को हटा देता है; Use Structure नया दस्तावेज़ खोलता है। टैप और ड्रैग Mac माउस इंटरैक्शन को प्रतिस्थापित करता है; स्रोत और ड्राइंग संपादक दस्तावेज़ कैनवास से अलग रहते हैं।
संपादक लेआउट
संपादक के तीन मुख्य क्षेत्र हैं:
- टूलबार: चुनें कि माउस या ट्रैकपैड अगला क्या करेगा, जैसे चयन करना, परमाणु खींचना, बंध खींचना, रिंग रखना, या मिटाना।
- कैनवास: बड़ी ड्राइंग क्षेत्र। परमाणु, बंध, टेम्पलेट और अभिक्रिया चिह्न रखने के लिए यहां क्लिक या ड्रैग करें।
- इंस्पेक्टर: दाईं ओर का पैनल। यह परमाणु और बंधों की संख्या, सूत्र, द्रव्यमान, वैलेंस जाँच, चयन क्रियाएँ, सफाई उपकरण और चयनित परमाणु या बंध के लिए विस्तृत गुण दिखाता है।
मूलभूत ड्राइंग कार्यप्रवाह
- कार्बन से शुरू करें। कार्बन कार्बनिक संरचनाओं के लिए सामान्य आरंभिक परमाणु है, और संपादक डिफ़ॉल्ट रूप से कार्बन का उपयोग करता है।
- आवश्यकता पड़ने पर एक तत्व चुनें। परमाणु रखने से पहले कार्बन से ऑक्सीजन, नाइट्रोजन, सल्फर, क्लोरीन या किसी अन्य सामान्य तत्व में स्विच करने के लिए तत्व मेनू का उपयोग करें।
- परमाणुओं के बीच बंध बनाएँ। बंध उपकरण चुनें और एक परमाणु से दूसरे परमाणु पर क्लिक या ड्रैग करें। एकल, द्वि, त्रि या अरोमैटिक बंधों के लिए बंध क्रम मेनू का उपयोग करें।
- सामान्य आकृतियों के लिए टेम्पलेट्स का उपयोग करें। रिंग और चेन टूल्स कार्बन चेन, साइक्लोहेक्सेन या बेंजीन जैसी संरचनाओं को शीघ्रता से स्थापित करते हैं।
- लेआउट को साफ़ करें। यदि ड्रॉइंग भीड़-भाड़ या असमान दिखती है, तो रासायनिक कनेक्शनों को बदले बिना 2D लेआउट को बेहतर बनाने के लिए इंस्पेक्टर में Clean Up का उपयोग करें।
- खोज चलाएँ या संपादन जारी रखें। क्वेरी खोज में, उपसंरचना या समानता चुनें, फिर खोज पर क्लिक करें।
उपकरण समूह
| टूल समूह | इसके लिए उपयोग करें | सरल भाषा में नोट्स |
|---|---|---|
| चयन उपकरण | चुनें, लासो, खंड, पैन और मिटाएँ। | मौजूदा भागों का चयन करने के लिए Select का उपयोग करें। Lasso चयन करने के लिए किसी क्षेत्र के चारों ओर रेखा खींचता है। Fragment जुड़े हुए टुकड़ों का चयन करने में मदद करता है। Pan दृश्य को स्थानांतरित करता है। Erase परमाणुओं, बंधों और प्रतिक्रिया चिह्नों को हटाता है। |
| परमाणु और बंध उपकरण | परमाणु, बंध, वेज, हैश, तरंगित, चार्ज+, चार्ज-, क्वेरी परमाणु, क्वेरी बंध, और परमाणु मानचित्र। | मुख्य रसायन विज्ञान आरेख के लिए इनका उपयोग करें। वेज और हैश बंध त्रि-आयामी दिशा को दर्शाते हैं। लहरदार का अर्थ है कि स्टीरियोकैमिस्ट्री अज्ञात या निर्दिष्ट नहीं है। आवेश सकारात्मक या नकारात्मक आवेशित परमाणुओं को दर्शाते हैं। |
| टेम्पलेट उपकरण | कार्बन श्रृंखला, साइक्लोप्रोपेन, साइक्लोब्यूटेन, साइक्लोपेंटेन, साइक्लोहेक्सेन, बेंजीन, और सहेजे गए टेम्पलेट्स। | सामान्य कार्बन श्रृंखलाओं और छल्लों के लिए टेम्पलेट्स समय बचाते हैं। बेंजीन एक अरोमैटिक छह-सदस्यीय छल्ला बनाता है। |
| प्रतिक्रिया उपकरण | प्रतिक्रिया तीर, प्रतिक्रिया प्लस, और प्रतिक्रिया माइनस। | प्रतिक्रिया का चित्रण करते समय इनका उपयोग करें। प्रतिक्रियाकारकों को तीर के बाईं ओर और उत्पादों को तीर के दाईं ओर रखें। प्लस और माइनस चिह्न प्रतिभागियों को अलग करते हैं या जहाँ आवश्यक हो, जोड़े गए/हटाए गए भागों को दर्शाते हैं। |
| दृश्य और इतिहास | रद्द करें, दोबारा करें, ज़ूम इन करें, ज़ूम आउट करें, और दृश्य रीसेट करें। | ये रासायनिक संरचना को नहीं बदलते, बल्कि आपके संपादन सत्र या दृश्य को बदलते हैं। रीसेट व्यू ड्रॉइंग को पुनः केंद्रित करता है। |
| क्लिपबोर्ड | नकल करें और चिपकाएँ। | अपने ड्राइंग के हिस्सों की नकल करने या संपादक सत्रों के बीच ड्राइंग की गई सामग्री को स्थानांतरित करने के लिए इसका उपयोग करें। |
परमाणु और बंध गुण
निरीक्षक में विवरण संपादित करने के लिए एक परमाणु या बंध चुनें।
- परमाणु लेबल और तत्व: कार्बन परमाणु को किसी अन्य तत्व में बदलें, या इस तरह का लेबल टाइप करें
Cl,N, याO. - आवेश: चार्ज टूल्स या एटम इंस्पेक्टर के साथ औपचारिक आवेश जोड़ें या हटाएँ। उदाहरण के लिए, अमोनियम नाइट्रोजन अक्सर धनात्मक होता है।
- आइसोटोप, रैडिकल, वैलेंस और एक्सप्लिसिट हाइड्रोजन: इन्हें केवल तभी उपयोग करें जब आपको पता हो कि संरचना को इनकी आवश्यकता है। अधिकांश सरल आरेखों के लिए स्वचालित हाइड्रोजन और वैलेंस हैंडलिंग पर्याप्त है।
- बंधन प्रकार: एकल, द्वि, त्रि या अरोमैटिक चुनें। द्विबंधन का अर्थ है दो साझा इलेक्ट्रॉन युग्म; अरोमैटिक बंध का उपयोग बेंजीन जैसी अरोमैटिक वलयों में होता है।
- स्टेरियो बंध: वेज और हैश बंध पृष्ठ से बाहर या पृष्ठ के पीछे की ओर इशारा करते हुए बंध दिखाते हैं। जब स्टीरियोकैमिस्ट्री महत्वपूर्ण हो, तब उनका उपयोग करें।
खोजने के लिए क्वेरी उपकरण
क्वेरी टूल्स यह बताते हैं कि खोज में क्या अनुमत है, बजाय इसके कि वे किसी एक सटीक परमाणु या बंध को चित्रित करें। ये तब उपयोगी होते हैं जब आप उस पैटर्न को जानते हैं जो आप चाहते हैं, लेकिन परिणाम के हर विवरण से परिचित नहीं होते।
- क्वेरी एटम का अर्थ "कोई भी एटम", "कोई भी हेटरो एटम", एक सामान्य समूह, या अनुमत या बहिष्कृत तत्वों की एक सूची हो सकता है।
- क्वेरी बॉन्ड एक से अधिक बॉन्ड प्रकार की अनुमति दे सकता है, या यह आवश्यक कर सकता है कि कोई बॉन्ड रिंग में हो या चेन में हो।
- एरोमैटिसिटी और टोपोलॉजी विकल्प यह बता सकते हैं कि कोई परमाणु या बंध एरोमैटिक, एलिफैटिक, रिंग में या चेन में होना चाहिए।
- जब आपको सटीक मिलान की आवश्यकता हो, तो सटीक परमाणु और बंधों का उपयोग करें। जब आप व्यापक खोज परिणाम चाहते हों, तो क्वेरी परमाणु और क्वेरी बंधों का उपयोग करें।
प्रतिक्रिया उपकरण
प्रतिक्रिया चित्र संरचनाओं को प्रतिक्रिया चिह्नों के साथ मिलाते हैं।
- प्रतिक्रिया तीर: अभिकारकों से उत्पादों की दिशा दिखाता है।
- प्रतिक्रिया प्लस: कई अभिकारकों या उत्पादों को अलग करता है।
- प्रतिक्रिया माइनस: आवश्यकता पड़ने पर घटाव-जैसी प्रतिक्रिया संकेतन को दर्शाता है।
- एटम मानचित्र: मानचित्र संख्याएँ जोड़ता है ताकि एक ही परमाणु अभिकरक से उत्पाद तक ट्रैक किया जा सके। यह अभिक्रिया विश्लेषण के लिए उपयोगी है, लेकिन सरल आरेखों के लिए वैकल्पिक है।
- प्रतिक्रिया भूमिका: जब किसी चयन को एक भूमिका सौंपी जा सकती है, तो निरीक्षक इसे अभिकारक, उत्पाद, एजेंट, उत्प्रेरक, अवस्था या विलायक के रूप में चिह्नित कर सकता है।
आपका चित्र जाँचना
निरीक्षक आपको खोज या निर्यात के लिए ड्राइंग का उपयोग करने से पहले सामान्य त्रुटियों को पकड़ने में मदद करता है।
- परमाणु और बंध आरेख के आकार को दर्शाते हैं।
- फ़ॉर्मूला और द्रव्यमान का अपडेट तब होता है जब AtomLens उन्हें गणना कर सकता है।
- Implicit H हाइड्रोजनों की गिनती करता है, AtomLens स्वचालित रूप से जोड़ता है। रेखाचित्रों में, कार्बन हाइड्रोजन अक्सर स्पष्ट रूप से नहीं बल्कि निहित रूप में दिखाए जाते हैं।
- वैलेन्स और वैलिडेशन चेतावनी देते हैं जब किसी परमाणु में सामान्य रसायन के लिए बहुत अधिक या बहुत कम बंध होते हैं।
- अरोमाटाइज़ और डीअरोमाटाइज़ स्विच उपयुक्त रिंग प्रणालियों को अरोमैटिक और वैकल्पिक-बंधन रूपों के बीच स्विच करते हैं।
- सेव टेम्पलेट एक चयनित खंड को संग्रहीत करता है ताकि आप बाद में टेम्पलेट मेनू से इसे पुन: उपयोग कर सकें।
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